組織架構
■沈立言教授出任中心主任
於99年8月4日進行新舊任主任交接，由前任主任江文章教授交接給現任主任沈立言教授。
其組織架構從原七組精簡為四組:
1.食品生化產品量產技術組由原來負責的周楚洋副教授擔任組長
2.儀器設備服務組由許輔教授擔任組長，
3.行政與企畫組由羅翊禎副教授擔任組長，
4.保健機能性食品研發組由蘇南維教授擔任組長。
■期間主要成果
1.主要技轉案與愛之味公司合作的保健機能類飲品”樂活飲”;
2.產學合作的成果包括:
(1)接受佳格公司的委託，進行新人蔘雞精護肝功能的研究；
(2)接受科達公司的委託，進行中草藥萃取物對抑制脂肪生成及抑制非酒精性脂肪肝炎之細胞活性評估研究；
(3)接受三洋藥品工業股份有限公司的委託，進行統固安液鈣離子濃度安定性研究等；
(4)接受經濟部工業局、科技部、農委會、衛生福利部中醫藥司及衛生福利部食品藥物管理署的委託，執行各項計畫。
3.於民國100年，在本中心的輔導下，成立國際食品保護協會臺灣分會，成為該國際組織的第四十八個分會;
4.於101年2月22日，成立臺灣的在地組織「臺灣食品保護協會」，以利協助上述國際組織之發展。
5.本中心另協助衛生福利部食品藥物管理署與臺大生物資源暨農學院成立「國家食品安全教育暨研究中心」，為人民的食品安全把關。
本中心在組織運作上，上設「諮議委員會」訂定本中心之研究發展方向，並推動與其他學術單位之合作，下置「保健機能性食品研發組」「食品生化產品量產技術組」、「儀器設備服務組」及「行政與企劃組」等 四組，執行本中心之各項任務。
■中心組織架構
| 所屬單位 | 職 稱 | 成 員 |
| 食品科技研究所 | 中心主任 | 沈立言 特聘教授 |
| 農業化學系 | 保健機能組組長 | 蘇南維 教授 |
| 食品科技研究所 | 食品生化產品量產技術組組長 | 陳明煦 助理教授 |
| 食品科技研究所 | 教育組組長 | 羅翊禎 教授 |
主任 Director■成員
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| 各組組長Heads of Section Divisions | |
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| 諮議委員會委員 Members of the Consultative Committee | |
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